Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc30Q8BVF4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc30Q8BVF4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms