Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TchpQ3TVW5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms