Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa10P31310 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms