Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMDP11532 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DMDP11532 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DMDP11532 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DMDP11532 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DMDP11532 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DMDP11532 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DMDP11532 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DMDP11532 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DMDP11532 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DMDP11532 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DMDP11532 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DMDP11532 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DMDP11532 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DMDP11532 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DMDP11532 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DMDP11532 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DMDP11532 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DMDP11532 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DMDP11532 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DMDP11532 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DMDP11532 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DMDP11532 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DMDP11532 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DMDP11532 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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