Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms