Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lhx6Q9R1R0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms