Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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