Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms