Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prkrip1Q9CWV6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkrip1Q9CWV6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms