Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx4Q6RUU0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms