Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smchd1Q6P5D8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms