Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Knl1Q66JQ7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms