Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms