Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms