Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf6Q3TWW8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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