Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CiartQ3TQ03 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CiartQ3TQ03 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms