Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lama1P19137 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lama1P19137 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lama1P19137 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lama1P19137 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lama1P19137 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms