Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2f6O54917 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2f6O54917 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2f6O54917 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2f6O54917 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f6O54917 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f6O54917 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms