Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms