Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit3W8DXL4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit3W8DXL4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrit3W8DXL4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrit3W8DXL4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrit3W8DXL4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrit3W8DXL4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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