Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gria4Q9Z2W8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gria4Q9Z2W8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gria4Q9Z2W8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gria4Q9Z2W8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gria4Q9Z2W8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gria4Q9Z2W8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gria4Q9Z2W8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gria4Q9Z2W8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gria4Q9Z2W8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gria4Q9Z2W8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gria4Q9Z2W8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gria4Q9Z2W8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gria4Q9Z2W8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gria4Q9Z2W8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gria4Q9Z2W8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gria4Q9Z2W8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gria4Q9Z2W8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gria4Q9Z2W8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gria4Q9Z2W8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gria4Q9Z2W8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gria4Q9Z2W8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gria4Q9Z2W8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gria4Q9Z2W8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gria4Q9Z2W8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gria4Q9Z2W8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gria4Q9Z2W8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gria4Q9Z2W8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gria4Q9Z2W8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gria4Q9Z2W8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gria4Q9Z2W8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gria4Q9Z2W8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gria4Q9Z2W8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gria4Q9Z2W8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gria4Q9Z2W8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gria4Q9Z2W8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gria4Q9Z2W8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gria4Q9Z2W8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gria4Q9Z2W8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gria4Q9Z2W8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gria4Q9Z2W8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gria4Q9Z2W8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gria4Q9Z2W8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gria4Q9Z2W8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gria4Q9Z2W8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gria4Q9Z2W8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gria4Q9Z2W8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gria4Q9Z2W8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gria4Q9Z2W8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gria4Q9Z2W8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gria4Q9Z2W8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gria4Q9Z2W8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gria4Q9Z2W8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gria4Q9Z2W8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms