Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc22d3Q9Z2S7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsc22d3Q9Z2S7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsc22d3Q9Z2S7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms