Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E5

Atoh7, Protein atonal homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh7Q9Z2E5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atoh7Q9Z2E5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atoh7Q9Z2E5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atoh7Q9Z2E5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh7Q9Z2E5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh7Q9Z2E5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh7Q9Z2E5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh7Q9Z2E5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh7Q9Z2E5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atoh7Q9Z2E5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atoh7Q9Z2E5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh7Q9Z2E5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh7Q9Z2E5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh7Q9Z2E5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh7Q9Z2E5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atoh7Q9Z2E5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atoh7Q9Z2E5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atoh7Q9Z2E5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atoh7Q9Z2E5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atoh7Q9Z2E5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atoh7Q9Z2E5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atoh7Q9Z2E5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atoh7Q9Z2E5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atoh7Q9Z2E5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atoh7Q9Z2E5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atoh7Q9Z2E5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atoh7Q9Z2E5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atoh7Q9Z2E5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atoh7Q9Z2E5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atoh7Q9Z2E5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atoh7Q9Z2E5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atoh7Q9Z2E5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atoh7Q9Z2E5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atoh7Q9Z2E5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atoh7Q9Z2E5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atoh7Q9Z2E5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atoh7Q9Z2E5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atoh7Q9Z2E5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atoh7Q9Z2E5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atoh7Q9Z2E5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atoh7Q9Z2E5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atoh7Q9Z2E5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atoh7Q9Z2E5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atoh7Q9Z2E5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atoh7Q9Z2E5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atoh7Q9Z2E5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atoh7Q9Z2E5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atoh7Q9Z2E5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atoh7Q9Z2E5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atoh7Q9Z2E5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atoh7Q9Z2E5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms