Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf1Q9Z1B8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf1Q9Z1B8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf1Q9Z1B8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf1Q9Z1B8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf1Q9Z1B8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf1Q9Z1B8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf1Q9Z1B8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf1Q9Z1B8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf1Q9Z1B8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf1Q9Z1B8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf1Q9Z1B8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Phf1Q9Z1B8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phf1Q9Z1B8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf1Q9Z1B8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf1Q9Z1B8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf1Q9Z1B8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf1Q9Z1B8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf1Q9Z1B8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf1Q9Z1B8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf1Q9Z1B8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf1Q9Z1B8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf1Q9Z1B8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf1Q9Z1B8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf1Q9Z1B8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf1Q9Z1B8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf1Q9Z1B8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf1Q9Z1B8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf1Q9Z1B8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf1Q9Z1B8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf1Q9Z1B8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf1Q9Z1B8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf1Q9Z1B8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf1Q9Z1B8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf1Q9Z1B8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf1Q9Z1B8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Phf1Q9Z1B8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf1Q9Z1B8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf1Q9Z1B8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf1Q9Z1B8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf1Q9Z1B8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf1Q9Z1B8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf1Q9Z1B8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms