Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xpr1Q9Z0U0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xpr1Q9Z0U0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xpr1Q9Z0U0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xpr1Q9Z0U0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xpr1Q9Z0U0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xpr1Q9Z0U0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xpr1Q9Z0U0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Xpr1Q9Z0U0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xpr1Q9Z0U0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xpr1Q9Z0U0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xpr1Q9Z0U0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xpr1Q9Z0U0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xpr1Q9Z0U0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Xpr1Q9Z0U0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xpr1Q9Z0U0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xpr1Q9Z0U0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xpr1Q9Z0U0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xpr1Q9Z0U0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xpr1Q9Z0U0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xpr1Q9Z0U0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Xpr1Q9Z0U0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xpr1Q9Z0U0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xpr1Q9Z0U0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Xpr1Q9Z0U0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xpr1Q9Z0U0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Xpr1Q9Z0U0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xpr1Q9Z0U0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xpr1Q9Z0U0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xpr1Q9Z0U0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xpr1Q9Z0U0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Xpr1Q9Z0U0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xpr1Q9Z0U0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xpr1Q9Z0U0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xpr1Q9Z0U0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xpr1Q9Z0U0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xpr1Q9Z0U0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xpr1Q9Z0U0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xpr1Q9Z0U0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Xpr1Q9Z0U0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Xpr1Q9Z0U0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xpr1Q9Z0U0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xpr1Q9Z0U0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xpr1Q9Z0U0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xpr1Q9Z0U0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xpr1Q9Z0U0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xpr1Q9Z0U0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xpr1Q9Z0U0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xpr1Q9Z0U0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xpr1Q9Z0U0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Xpr1Q9Z0U0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xpr1Q9Z0U0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xpr1Q9Z0U0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xpr1Q9Z0U0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xpr1Q9Z0U0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xpr1Q9Z0U0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xpr1Q9Z0U0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xpr1Q9Z0U0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xpr1Q9Z0U0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms