Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn13Q9Z0S4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn13Q9Z0S4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn13Q9Z0S4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn13Q9Z0S4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn13Q9Z0S4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn13Q9Z0S4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn13Q9Z0S4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn13Q9Z0S4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn13Q9Z0S4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn13Q9Z0S4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn13Q9Z0S4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn13Q9Z0S4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn13Q9Z0S4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn13Q9Z0S4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn13Q9Z0S4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn13Q9Z0S4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn13Q9Z0S4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn13Q9Z0S4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn13Q9Z0S4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn13Q9Z0S4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn13Q9Z0S4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn13Q9Z0S4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn13Q9Z0S4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn13Q9Z0S4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cldn13Q9Z0S4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn13Q9Z0S4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn13Q9Z0S4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn13Q9Z0S4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn13Q9Z0S4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn13Q9Z0S4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn13Q9Z0S4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn13Q9Z0S4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn13Q9Z0S4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn13Q9Z0S4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn13Q9Z0S4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn13Q9Z0S4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn13Q9Z0S4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn13Q9Z0S4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn13Q9Z0S4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn13Q9Z0S4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn13Q9Z0S4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn13Q9Z0S4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn13Q9Z0S4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn13Q9Z0S4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn13Q9Z0S4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn13Q9Z0S4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn13Q9Z0S4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms