Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lhx9Q9WUH2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lhx9Q9WUH2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lhx9Q9WUH2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lhx9Q9WUH2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lhx9Q9WUH2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lhx9Q9WUH2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lhx9Q9WUH2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lhx9Q9WUH2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lhx9Q9WUH2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lhx9Q9WUH2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lhx9Q9WUH2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lhx9Q9WUH2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lhx9Q9WUH2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lhx9Q9WUH2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lhx9Q9WUH2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lhx9Q9WUH2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lhx9Q9WUH2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lhx9Q9WUH2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lhx9Q9WUH2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lhx9Q9WUH2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lhx9Q9WUH2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lhx9Q9WUH2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lhx9Q9WUH2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lhx9Q9WUH2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lhx9Q9WUH2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lhx9Q9WUH2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lhx9Q9WUH2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lhx9Q9WUH2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lhx9Q9WUH2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhx9Q9WUH2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhx9Q9WUH2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhx9Q9WUH2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhx9Q9WUH2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhx9Q9WUH2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lhx9Q9WUH2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lhx9Q9WUH2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lhx9Q9WUH2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lhx9Q9WUH2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lhx9Q9WUH2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lhx9Q9WUH2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lhx9Q9WUH2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lhx9Q9WUH2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lhx9Q9WUH2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lhx9Q9WUH2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lhx9Q9WUH2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lhx9Q9WUH2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lhx9Q9WUH2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lhx9Q9WUH2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lhx9Q9WUH2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lhx9Q9WUH2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhx9Q9WUH2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhx9Q9WUH2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lhx9Q9WUH2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lhx9Q9WUH2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lhx9Q9WUH2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lhx9Q9WUH2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms