Protein–RNA interactions for Protein: Q9R216

Fzd9, Frizzled-9, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd9Q9R216 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fzd9Q9R216 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fzd9Q9R216 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fzd9Q9R216 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fzd9Q9R216 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Fzd9Q9R216 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fzd9Q9R216 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fzd9Q9R216 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fzd9Q9R216 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fzd9Q9R216 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fzd9Q9R216 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fzd9Q9R216 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fzd9Q9R216 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fzd9Q9R216 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fzd9Q9R216 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Fzd9Q9R216 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Fzd9Q9R216 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Fzd9Q9R216 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fzd9Q9R216 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Fzd9Q9R216 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Fzd9Q9R216 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Fzd9Q9R216 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Fzd9Q9R216 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fzd9Q9R216 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fzd9Q9R216 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Fzd9Q9R216 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fzd9Q9R216 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fzd9Q9R216 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fzd9Q9R216 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fzd9Q9R216 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fzd9Q9R216 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fzd9Q9R216 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Fzd9Q9R216 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fzd9Q9R216 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Fzd9Q9R216 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Fzd9Q9R216 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fzd9Q9R216 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fzd9Q9R216 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fzd9Q9R216 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fzd9Q9R216 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fzd9Q9R216 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fzd9Q9R216 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fzd9Q9R216 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fzd9Q9R216 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fzd9Q9R216 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fzd9Q9R216 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fzd9Q9R216 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fzd9Q9R216 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fzd9Q9R216 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fzd9Q9R216 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fzd9Q9R216 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fzd9Q9R216 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fzd9Q9R216 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fzd9Q9R216 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Fzd9Q9R216 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fzd9Q9R216 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fzd9Q9R216 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fzd9Q9R216 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fzd9Q9R216 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fzd9Q9R216 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fzd9Q9R216 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fzd9Q9R216 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fzd9Q9R216 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Fzd9Q9R216 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fzd9Q9R216 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fzd9Q9R216 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Fzd9Q9R216 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fzd9Q9R216 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fzd9Q9R216 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fzd9Q9R216 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fzd9Q9R216 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fzd9Q9R216 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fzd9Q9R216 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Fzd9Q9R216 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Fzd9Q9R216 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fzd9Q9R216 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fzd9Q9R216 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Fzd9Q9R216 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Fzd9Q9R216 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fzd9Q9R216 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fzd9Q9R216 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fzd9Q9R216 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fzd9Q9R216 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fzd9Q9R216 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fzd9Q9R216 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fzd9Q9R216 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fzd9Q9R216 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fzd9Q9R216 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fzd9Q9R216 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fzd9Q9R216 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fzd9Q9R216 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fzd9Q9R216 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fzd9Q9R216 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fzd9Q9R216 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fzd9Q9R216 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fzd9Q9R216 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fzd9Q9R216 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fzd9Q9R216 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fzd9Q9R216 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fzd9Q9R216 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms