Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfwd2Q9R1A8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfwd2Q9R1A8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rfwd2Q9R1A8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfwd2Q9R1A8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rfwd2Q9R1A8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rfwd2Q9R1A8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rfwd2Q9R1A8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rfwd2Q9R1A8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfwd2Q9R1A8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfwd2Q9R1A8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfwd2Q9R1A8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfwd2Q9R1A8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfwd2Q9R1A8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfwd2Q9R1A8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfwd2Q9R1A8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfwd2Q9R1A8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfwd2Q9R1A8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfwd2Q9R1A8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfwd2Q9R1A8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfwd2Q9R1A8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfwd2Q9R1A8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfwd2Q9R1A8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfwd2Q9R1A8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfwd2Q9R1A8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfwd2Q9R1A8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfwd2Q9R1A8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfwd2Q9R1A8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfwd2Q9R1A8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfwd2Q9R1A8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfwd2Q9R1A8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfwd2Q9R1A8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfwd2Q9R1A8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfwd2Q9R1A8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfwd2Q9R1A8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfwd2Q9R1A8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfwd2Q9R1A8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfwd2Q9R1A8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfwd2Q9R1A8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfwd2Q9R1A8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfwd2Q9R1A8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfwd2Q9R1A8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfwd2Q9R1A8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfwd2Q9R1A8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfwd2Q9R1A8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfwd2Q9R1A8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfwd2Q9R1A8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfwd2Q9R1A8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfwd2Q9R1A8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfwd2Q9R1A8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfwd2Q9R1A8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfwd2Q9R1A8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfwd2Q9R1A8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfwd2Q9R1A8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfwd2Q9R1A8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfwd2Q9R1A8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rfwd2Q9R1A8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfwd2Q9R1A8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfwd2Q9R1A8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfwd2Q9R1A8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfwd2Q9R1A8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfwd2Q9R1A8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfwd2Q9R1A8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfwd2Q9R1A8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfwd2Q9R1A8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfwd2Q9R1A8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfwd2Q9R1A8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfwd2Q9R1A8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfwd2Q9R1A8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfwd2Q9R1A8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfwd2Q9R1A8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfwd2Q9R1A8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfwd2Q9R1A8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfwd2Q9R1A8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfwd2Q9R1A8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfwd2Q9R1A8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfwd2Q9R1A8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfwd2Q9R1A8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfwd2Q9R1A8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfwd2Q9R1A8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms