Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N9

Syt9, Synaptotagmin-9, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt9Q9R0N9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syt9Q9R0N9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt9Q9R0N9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt9Q9R0N9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt9Q9R0N9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt9Q9R0N9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt9Q9R0N9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt9Q9R0N9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt9Q9R0N9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt9Q9R0N9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt9Q9R0N9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt9Q9R0N9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syt9Q9R0N9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syt9Q9R0N9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt9Q9R0N9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt9Q9R0N9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt9Q9R0N9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syt9Q9R0N9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syt9Q9R0N9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syt9Q9R0N9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt9Q9R0N9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt9Q9R0N9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt9Q9R0N9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syt9Q9R0N9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt9Q9R0N9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt9Q9R0N9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt9Q9R0N9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt9Q9R0N9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt9Q9R0N9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt9Q9R0N9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt9Q9R0N9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt9Q9R0N9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syt9Q9R0N9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt9Q9R0N9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt9Q9R0N9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syt9Q9R0N9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syt9Q9R0N9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syt9Q9R0N9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syt9Q9R0N9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syt9Q9R0N9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syt9Q9R0N9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syt9Q9R0N9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syt9Q9R0N9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syt9Q9R0N9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syt9Q9R0N9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syt9Q9R0N9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syt9Q9R0N9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt9Q9R0N9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt9Q9R0N9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt9Q9R0N9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms