Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Lamc3Q9R0B6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Lamc3Q9R0B6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Lamc3Q9R0B6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Lamc3Q9R0B6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Lamc3Q9R0B6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
Lamc3Q9R0B6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
Lamc3Q9R0B6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Lamc3Q9R0B6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
Lamc3Q9R0B6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Lamc3Q9R0B6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Lamc3Q9R0B6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Lamc3Q9R0B6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Lamc3Q9R0B6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
Lamc3Q9R0B6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Lamc3Q9R0B6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Lamc3Q9R0B6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Lamc3Q9R0B6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Lamc3Q9R0B6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Lamc3Q9R0B6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
Lamc3Q9R0B6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Lamc3Q9R0B6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Lamc3Q9R0B6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
Lamc3Q9R0B6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Lamc3Q9R0B6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Lamc3Q9R0B6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Lamc3Q9R0B6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Lamc3Q9R0B6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
Lamc3Q9R0B6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Lamc3Q9R0B6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Lamc3Q9R0B6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.58
Lamc3Q9R0B6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
Lamc3Q9R0B6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Lamc3Q9R0B6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Lamc3Q9R0B6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
Lamc3Q9R0B6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
Lamc3Q9R0B6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Lamc3Q9R0B6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Lamc3Q9R0B6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Lamc3Q9R0B6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Lamc3Q9R0B6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC43.57■■■■■ 4.57
Lamc3Q9R0B6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Lamc3Q9R0B6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
Lamc3Q9R0B6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Lamc3Q9R0B6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
Lamc3Q9R0B6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
Lamc3Q9R0B6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC43.44■■■■■ 4.54
Lamc3Q9R0B6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Lamc3Q9R0B6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Lamc3Q9R0B6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Lamc3Q9R0B6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Lamc3Q9R0B6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
Lamc3Q9R0B6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Lamc3Q9R0B6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Lamc3Q9R0B6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
Lamc3Q9R0B6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Lamc3Q9R0B6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC43.34■■■■■ 4.53
Lamc3Q9R0B6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Lamc3Q9R0B6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
Lamc3Q9R0B6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Lamc3Q9R0B6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Lamc3Q9R0B6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Lamc3Q9R0B6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Lamc3Q9R0B6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Lamc3Q9R0B6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Lamc3Q9R0B6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Lamc3Q9R0B6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Lamc3Q9R0B6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Lamc3Q9R0B6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
Lamc3Q9R0B6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Lamc3Q9R0B6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
Lamc3Q9R0B6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Lamc3Q9R0B6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Lamc3Q9R0B6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Lamc3Q9R0B6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.5
Lamc3Q9R0B6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.5
Lamc3Q9R0B6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Lamc3Q9R0B6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Lamc3Q9R0B6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Lamc3Q9R0B6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Lamc3Q9R0B6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
Lamc3Q9R0B6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Lamc3Q9R0B6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Lamc3Q9R0B6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Lamc3Q9R0B6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Lamc3Q9R0B6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Lamc3Q9R0B6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
Lamc3Q9R0B6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Lamc3Q9R0B6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
Lamc3Q9R0B6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
Lamc3Q9R0B6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Lamc3Q9R0B6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Lamc3Q9R0B6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Lamc3Q9R0B6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Lamc3Q9R0B6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Lamc3Q9R0B6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Lamc3Q9R0B6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Lamc3Q9R0B6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
Lamc3Q9R0B6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms