Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SpastQ9QYY8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpastQ9QYY8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpastQ9QYY8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpastQ9QYY8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SpastQ9QYY8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SpastQ9QYY8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpastQ9QYY8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpastQ9QYY8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpastQ9QYY8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpastQ9QYY8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpastQ9QYY8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SpastQ9QYY8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpastQ9QYY8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SpastQ9QYY8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpastQ9QYY8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpastQ9QYY8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpastQ9QYY8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpastQ9QYY8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpastQ9QYY8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpastQ9QYY8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpastQ9QYY8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpastQ9QYY8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpastQ9QYY8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpastQ9QYY8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpastQ9QYY8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpastQ9QYY8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpastQ9QYY8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SpastQ9QYY8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SpastQ9QYY8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpastQ9QYY8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpastQ9QYY8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SpastQ9QYY8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SpastQ9QYY8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpastQ9QYY8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpastQ9QYY8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SpastQ9QYY8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SpastQ9QYY8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SpastQ9QYY8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms