Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmeff2Q9QYM9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmeff2Q9QYM9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmeff2Q9QYM9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmeff2Q9QYM9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmeff2Q9QYM9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmeff2Q9QYM9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmeff2Q9QYM9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmeff2Q9QYM9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmeff2Q9QYM9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmeff2Q9QYM9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmeff2Q9QYM9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmeff2Q9QYM9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmeff2Q9QYM9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmeff2Q9QYM9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmeff2Q9QYM9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmeff2Q9QYM9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmeff2Q9QYM9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmeff2Q9QYM9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmeff2Q9QYM9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmeff2Q9QYM9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmeff2Q9QYM9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmeff2Q9QYM9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmeff2Q9QYM9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmeff2Q9QYM9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmeff2Q9QYM9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmeff2Q9QYM9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmeff2Q9QYM9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmeff2Q9QYM9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmeff2Q9QYM9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmeff2Q9QYM9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmeff2Q9QYM9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmeff2Q9QYM9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmeff2Q9QYM9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmeff2Q9QYM9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmeff2Q9QYM9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmeff2Q9QYM9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmeff2Q9QYM9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmeff2Q9QYM9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmeff2Q9QYM9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmeff2Q9QYM9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmeff2Q9QYM9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmeff2Q9QYM9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmeff2Q9QYM9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmeff2Q9QYM9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmeff2Q9QYM9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmeff2Q9QYM9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmeff2Q9QYM9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmeff2Q9QYM9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmeff2Q9QYM9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmeff2Q9QYM9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmeff2Q9QYM9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmeff2Q9QYM9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmeff2Q9QYM9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmeff2Q9QYM9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmeff2Q9QYM9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmeff2Q9QYM9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmeff2Q9QYM9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmeff2Q9QYM9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmeff2Q9QYM9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmeff2Q9QYM9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmeff2Q9QYM9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmeff2Q9QYM9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmeff2Q9QYM9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmeff2Q9QYM9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmeff2Q9QYM9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmeff2Q9QYM9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmeff2Q9QYM9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmeff2Q9QYM9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms