Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnpy2Q9QXT0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnpy2Q9QXT0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnpy2Q9QXT0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnpy2Q9QXT0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnpy2Q9QXT0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnpy2Q9QXT0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnpy2Q9QXT0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnpy2Q9QXT0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnpy2Q9QXT0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnpy2Q9QXT0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cnpy2Q9QXT0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cnpy2Q9QXT0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnpy2Q9QXT0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnpy2Q9QXT0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnpy2Q9QXT0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cnpy2Q9QXT0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cnpy2Q9QXT0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnpy2Q9QXT0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cnpy2Q9QXT0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cnpy2Q9QXT0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cnpy2Q9QXT0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnpy2Q9QXT0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnpy2Q9QXT0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnpy2Q9QXT0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnpy2Q9QXT0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnpy2Q9QXT0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnpy2Q9QXT0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnpy2Q9QXT0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cnpy2Q9QXT0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cnpy2Q9QXT0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnpy2Q9QXT0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnpy2Q9QXT0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnpy2Q9QXT0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnpy2Q9QXT0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnpy2Q9QXT0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cnpy2Q9QXT0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cnpy2Q9QXT0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cnpy2Q9QXT0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cnpy2Q9QXT0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cnpy2Q9QXT0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnpy2Q9QXT0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnpy2Q9QXT0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnpy2Q9QXT0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnpy2Q9QXT0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnpy2Q9QXT0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnpy2Q9QXT0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnpy2Q9QXT0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnpy2Q9QXT0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnpy2Q9QXT0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnpy2Q9QXT0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnpy2Q9QXT0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cnpy2Q9QXT0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnpy2Q9QXT0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnpy2Q9QXT0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnpy2Q9QXT0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnpy2Q9QXT0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnpy2Q9QXT0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnpy2Q9QXT0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnpy2Q9QXT0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnpy2Q9QXT0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnpy2Q9QXT0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnpy2Q9QXT0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnpy2Q9QXT0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnpy2Q9QXT0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnpy2Q9QXT0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnpy2Q9QXT0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnpy2Q9QXT0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnpy2Q9QXT0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnpy2Q9QXT0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnpy2Q9QXT0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnpy2Q9QXT0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnpy2Q9QXT0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnpy2Q9QXT0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnpy2Q9QXT0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnpy2Q9QXT0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnpy2Q9QXT0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnpy2Q9QXT0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnpy2Q9QXT0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnpy2Q9QXT0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnpy2Q9QXT0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnpy2Q9QXT0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnpy2Q9QXT0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnpy2Q9QXT0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnpy2Q9QXT0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnpy2Q9QXT0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnpy2Q9QXT0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms