Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Phc2Q9QWH1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phc2Q9QWH1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phc2Q9QWH1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phc2Q9QWH1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phc2Q9QWH1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phc2Q9QWH1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phc2Q9QWH1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phc2Q9QWH1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phc2Q9QWH1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phc2Q9QWH1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phc2Q9QWH1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Phc2Q9QWH1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phc2Q9QWH1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phc2Q9QWH1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phc2Q9QWH1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phc2Q9QWH1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phc2Q9QWH1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Phc2Q9QWH1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phc2Q9QWH1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phc2Q9QWH1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phc2Q9QWH1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phc2Q9QWH1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phc2Q9QWH1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phc2Q9QWH1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms