Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Chaf1aQ9QWF0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chaf1aQ9QWF0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chaf1aQ9QWF0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chaf1aQ9QWF0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chaf1aQ9QWF0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chaf1aQ9QWF0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chaf1aQ9QWF0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Chaf1aQ9QWF0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chaf1aQ9QWF0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chaf1aQ9QWF0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chaf1aQ9QWF0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chaf1aQ9QWF0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chaf1aQ9QWF0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chaf1aQ9QWF0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Chaf1aQ9QWF0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chaf1aQ9QWF0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chaf1aQ9QWF0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chaf1aQ9QWF0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chaf1aQ9QWF0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chaf1aQ9QWF0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Chaf1aQ9QWF0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chaf1aQ9QWF0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Chaf1aQ9QWF0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chaf1aQ9QWF0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chaf1aQ9QWF0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chaf1aQ9QWF0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chaf1aQ9QWF0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chaf1aQ9QWF0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chaf1aQ9QWF0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chaf1aQ9QWF0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chaf1aQ9QWF0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chaf1aQ9QWF0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chaf1aQ9QWF0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chaf1aQ9QWF0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chaf1aQ9QWF0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chaf1aQ9QWF0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chaf1aQ9QWF0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chaf1aQ9QWF0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chaf1aQ9QWF0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chaf1aQ9QWF0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chaf1aQ9QWF0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chaf1aQ9QWF0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chaf1aQ9QWF0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chaf1aQ9QWF0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chaf1aQ9QWF0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chaf1aQ9QWF0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chaf1aQ9QWF0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chaf1aQ9QWF0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chaf1aQ9QWF0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chaf1aQ9QWF0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chaf1aQ9QWF0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chaf1aQ9QWF0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chaf1aQ9QWF0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Chaf1aQ9QWF0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chaf1aQ9QWF0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chaf1aQ9QWF0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Chaf1aQ9QWF0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chaf1aQ9QWF0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chaf1aQ9QWF0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chaf1aQ9QWF0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chaf1aQ9QWF0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chaf1aQ9QWF0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chaf1aQ9QWF0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chaf1aQ9QWF0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chaf1aQ9QWF0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chaf1aQ9QWF0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chaf1aQ9QWF0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms