Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msh5Q9QUM7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msh5Q9QUM7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msh5Q9QUM7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msh5Q9QUM7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msh5Q9QUM7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msh5Q9QUM7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Msh5Q9QUM7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Msh5Q9QUM7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Msh5Q9QUM7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Msh5Q9QUM7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Msh5Q9QUM7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Msh5Q9QUM7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Msh5Q9QUM7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msh5Q9QUM7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msh5Q9QUM7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msh5Q9QUM7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msh5Q9QUM7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Msh5Q9QUM7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msh5Q9QUM7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msh5Q9QUM7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msh5Q9QUM7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msh5Q9QUM7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msh5Q9QUM7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Msh5Q9QUM7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msh5Q9QUM7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msh5Q9QUM7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msh5Q9QUM7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msh5Q9QUM7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msh5Q9QUM7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msh5Q9QUM7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msh5Q9QUM7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msh5Q9QUM7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msh5Q9QUM7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msh5Q9QUM7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msh5Q9QUM7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msh5Q9QUM7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msh5Q9QUM7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Msh5Q9QUM7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msh5Q9QUM7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Msh5Q9QUM7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msh5Q9QUM7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msh5Q9QUM7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Msh5Q9QUM7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Msh5Q9QUM7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Msh5Q9QUM7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Msh5Q9QUM7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Msh5Q9QUM7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Msh5Q9QUM7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Msh5Q9QUM7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Msh5Q9QUM7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Msh5Q9QUM7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Msh5Q9QUM7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msh5Q9QUM7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Msh5Q9QUM7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msh5Q9QUM7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msh5Q9QUM7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms