Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc2lQ9JME7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc2lQ9JME7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc2lQ9JME7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc2lQ9JME7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc2lQ9JME7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc2lQ9JME7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc2lQ9JME7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc2lQ9JME7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc2lQ9JME7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc2lQ9JME7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc2lQ9JME7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc2lQ9JME7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc2lQ9JME7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc2lQ9JME7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc2lQ9JME7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc2lQ9JME7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc2lQ9JME7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc2lQ9JME7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc2lQ9JME7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc2lQ9JME7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc2lQ9JME7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc2lQ9JME7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc2lQ9JME7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc2lQ9JME7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc2lQ9JME7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc2lQ9JME7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc2lQ9JME7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms