Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpa33Q9JKA5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpa33Q9JKA5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpa33Q9JKA5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpa33Q9JKA5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpa33Q9JKA5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpa33Q9JKA5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpa33Q9JKA5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpa33Q9JKA5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpa33Q9JKA5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpa33Q9JKA5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpa33Q9JKA5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpa33Q9JKA5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpa33Q9JKA5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpa33Q9JKA5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpa33Q9JKA5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpa33Q9JKA5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpa33Q9JKA5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpa33Q9JKA5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpa33Q9JKA5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpa33Q9JKA5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpa33Q9JKA5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpa33Q9JKA5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpa33Q9JKA5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpa33Q9JKA5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpa33Q9JKA5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpa33Q9JKA5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpa33Q9JKA5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpa33Q9JKA5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gpa33Q9JKA5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpa33Q9JKA5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gpa33Q9JKA5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpa33Q9JKA5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpa33Q9JKA5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpa33Q9JKA5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpa33Q9JKA5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpa33Q9JKA5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpa33Q9JKA5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpa33Q9JKA5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpa33Q9JKA5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpa33Q9JKA5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms