Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ddx20Q9JJY4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Ddx20Q9JJY4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ddx20Q9JJY4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ddx20Q9JJY4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ddx20Q9JJY4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ddx20Q9JJY4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ddx20Q9JJY4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ddx20Q9JJY4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ddx20Q9JJY4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Ddx20Q9JJY4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ddx20Q9JJY4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddx20Q9JJY4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddx20Q9JJY4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ddx20Q9JJY4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddx20Q9JJY4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddx20Q9JJY4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddx20Q9JJY4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ddx20Q9JJY4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ddx20Q9JJY4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ddx20Q9JJY4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ddx20Q9JJY4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ddx20Q9JJY4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ddx20Q9JJY4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ddx20Q9JJY4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ddx20Q9JJY4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ddx20Q9JJY4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ddx20Q9JJY4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ddx20Q9JJY4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ddx20Q9JJY4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ddx20Q9JJY4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ddx20Q9JJY4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ddx20Q9JJY4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ddx20Q9JJY4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ddx20Q9JJY4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ddx20Q9JJY4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ddx20Q9JJY4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ddx20Q9JJY4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ddx20Q9JJY4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ddx20Q9JJY4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ddx20Q9JJY4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ddx20Q9JJY4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ddx20Q9JJY4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ddx20Q9JJY4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ddx20Q9JJY4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ddx20Q9JJY4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ddx20Q9JJY4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ddx20Q9JJY4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ddx20Q9JJY4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ddx20Q9JJY4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ddx20Q9JJY4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ddx20Q9JJY4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ddx20Q9JJY4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ddx20Q9JJY4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ddx20Q9JJY4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ddx20Q9JJY4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ddx20Q9JJY4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ddx20Q9JJY4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ddx20Q9JJY4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ddx20Q9JJY4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ddx20Q9JJY4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ddx20Q9JJY4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ddx20Q9JJY4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ddx20Q9JJY4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ddx20Q9JJY4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ddx20Q9JJY4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ddx20Q9JJY4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ddx20Q9JJY4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ddx20Q9JJY4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ddx20Q9JJY4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ddx20Q9JJY4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ddx20Q9JJY4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ddx20Q9JJY4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ddx20Q9JJY4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ddx20Q9JJY4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ddx20Q9JJY4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ddx20Q9JJY4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ddx20Q9JJY4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ddx20Q9JJY4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ddx20Q9JJY4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ddx20Q9JJY4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ddx20Q9JJY4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ddx20Q9JJY4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ddx20Q9JJY4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ddx20Q9JJY4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ddx20Q9JJY4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ddx20Q9JJY4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ddx20Q9JJY4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ddx20Q9JJY4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ddx20Q9JJY4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ddx20Q9JJY4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ddx20Q9JJY4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ddx20Q9JJY4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ddx20Q9JJY4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ddx20Q9JJY4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ddx20Q9JJY4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ddx20Q9JJY4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ddx20Q9JJY4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ddx20Q9JJY4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ddx20Q9JJY4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
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