Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacng3Q9JJV5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacng3Q9JJV5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacng3Q9JJV5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacng3Q9JJV5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacng3Q9JJV5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacng3Q9JJV5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cacng3Q9JJV5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacng3Q9JJV5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacng3Q9JJV5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacng3Q9JJV5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacng3Q9JJV5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacng3Q9JJV5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacng3Q9JJV5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacng3Q9JJV5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacng3Q9JJV5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacng3Q9JJV5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacng3Q9JJV5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacng3Q9JJV5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacng3Q9JJV5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacng3Q9JJV5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacng3Q9JJV5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacng3Q9JJV5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacng3Q9JJV5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacng3Q9JJV5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacng3Q9JJV5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacng3Q9JJV5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacng3Q9JJV5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacng3Q9JJV5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cacng3Q9JJV5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacng3Q9JJV5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacng3Q9JJV5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacng3Q9JJV5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacng3Q9JJV5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacng3Q9JJV5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacng3Q9JJV5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacng3Q9JJV5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacng3Q9JJV5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacng3Q9JJV5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacng3Q9JJV5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacng3Q9JJV5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacng3Q9JJV5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacng3Q9JJV5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacng3Q9JJV5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacng3Q9JJV5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacng3Q9JJV5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacng3Q9JJV5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacng3Q9JJV5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacng3Q9JJV5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacng3Q9JJV5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacng3Q9JJV5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacng3Q9JJV5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms