Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bgrlQ9JJU8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bgrlQ9JJU8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrlQ9JJU8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrlQ9JJU8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bgrlQ9JJU8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bgrlQ9JJU8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms