Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smad9Q9JIW5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smad9Q9JIW5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smad9Q9JIW5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smad9Q9JIW5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smad9Q9JIW5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smad9Q9JIW5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smad9Q9JIW5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smad9Q9JIW5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad9Q9JIW5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smad9Q9JIW5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smad9Q9JIW5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smad9Q9JIW5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smad9Q9JIW5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smad9Q9JIW5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smad9Q9JIW5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad9Q9JIW5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad9Q9JIW5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smad9Q9JIW5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smad9Q9JIW5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smad9Q9JIW5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smad9Q9JIW5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smad9Q9JIW5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smad9Q9JIW5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smad9Q9JIW5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smad9Q9JIW5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smad9Q9JIW5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smad9Q9JIW5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smad9Q9JIW5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smad9Q9JIW5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smad9Q9JIW5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smad9Q9JIW5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smad9Q9JIW5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smad9Q9JIW5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smad9Q9JIW5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smad9Q9JIW5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smad9Q9JIW5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smad9Q9JIW5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Smad9Q9JIW5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smad9Q9JIW5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Smad9Q9JIW5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smad9Q9JIW5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smad9Q9JIW5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smad9Q9JIW5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad9Q9JIW5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad9Q9JIW5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad9Q9JIW5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smad9Q9JIW5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smad9Q9JIW5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smad9Q9JIW5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smad9Q9JIW5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smad9Q9JIW5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smad9Q9JIW5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smad9Q9JIW5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smad9Q9JIW5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smad9Q9JIW5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smad9Q9JIW5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smad9Q9JIW5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad9Q9JIW5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad9Q9JIW5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad9Q9JIW5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smad9Q9JIW5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smad9Q9JIW5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smad9Q9JIW5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smad9Q9JIW5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smad9Q9JIW5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smad9Q9JIW5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad9Q9JIW5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad9Q9JIW5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smad9Q9JIW5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smad9Q9JIW5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smad9Q9JIW5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smad9Q9JIW5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smad9Q9JIW5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smad9Q9JIW5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smad9Q9JIW5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smad9Q9JIW5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smad9Q9JIW5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad9Q9JIW5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smad9Q9JIW5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smad9Q9JIW5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad9Q9JIW5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad9Q9JIW5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms