Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc12a4Q9JIS8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc12a4Q9JIS8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc12a4Q9JIS8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc12a4Q9JIS8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc12a4Q9JIS8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc12a4Q9JIS8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc12a4Q9JIS8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc12a4Q9JIS8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc12a4Q9JIS8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc12a4Q9JIS8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc12a4Q9JIS8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc12a4Q9JIS8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc12a4Q9JIS8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc12a4Q9JIS8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc12a4Q9JIS8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc12a4Q9JIS8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc12a4Q9JIS8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc12a4Q9JIS8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc12a4Q9JIS8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc12a4Q9JIS8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc12a4Q9JIS8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc12a4Q9JIS8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc12a4Q9JIS8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc12a4Q9JIS8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc12a4Q9JIS8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc12a4Q9JIS8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc12a4Q9JIS8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc12a4Q9JIS8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc12a4Q9JIS8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc12a4Q9JIS8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc12a4Q9JIS8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc12a4Q9JIS8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc12a4Q9JIS8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc12a4Q9JIS8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc12a4Q9JIS8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc12a4Q9JIS8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc12a4Q9JIS8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc12a4Q9JIS8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc12a4Q9JIS8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc12a4Q9JIS8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc12a4Q9JIS8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc12a4Q9JIS8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc12a4Q9JIS8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc12a4Q9JIS8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc12a4Q9JIS8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc12a4Q9JIS8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc12a4Q9JIS8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc12a4Q9JIS8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc12a4Q9JIS8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc12a4Q9JIS8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc12a4Q9JIS8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms