Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc9a3r2Q9JHL1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a3r2Q9JHL1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a3r2Q9JHL1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc9a3r2Q9JHL1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a3r2Q9JHL1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a3r2Q9JHL1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9a3r2Q9JHL1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9a3r2Q9JHL1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9a3r2Q9JHL1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9a3r2Q9JHL1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a3r2Q9JHL1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9a3r2Q9JHL1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a3r2Q9JHL1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9a3r2Q9JHL1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a3r2Q9JHL1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms