Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Capn10Q9ESK3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Capn10Q9ESK3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Capn10Q9ESK3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Capn10Q9ESK3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Capn10Q9ESK3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Capn10Q9ESK3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Capn10Q9ESK3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Capn10Q9ESK3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Capn10Q9ESK3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Capn10Q9ESK3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Capn10Q9ESK3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Capn10Q9ESK3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Capn10Q9ESK3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Capn10Q9ESK3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Capn10Q9ESK3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Capn10Q9ESK3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Capn10Q9ESK3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Capn10Q9ESK3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Capn10Q9ESK3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Capn10Q9ESK3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Capn10Q9ESK3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Capn10Q9ESK3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Capn10Q9ESK3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Capn10Q9ESK3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Capn10Q9ESK3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Capn10Q9ESK3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Capn10Q9ESK3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Capn10Q9ESK3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Capn10Q9ESK3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Capn10Q9ESK3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Capn10Q9ESK3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Capn10Q9ESK3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Capn10Q9ESK3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Capn10Q9ESK3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Capn10Q9ESK3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Capn10Q9ESK3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Capn10Q9ESK3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Capn10Q9ESK3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Capn10Q9ESK3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Capn10Q9ESK3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Capn10Q9ESK3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Capn10Q9ESK3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Capn10Q9ESK3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Capn10Q9ESK3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Capn10Q9ESK3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Capn10Q9ESK3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Capn10Q9ESK3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Capn10Q9ESK3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Capn10Q9ESK3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Capn10Q9ESK3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Capn10Q9ESK3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Capn10Q9ESK3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Capn10Q9ESK3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Capn10Q9ESK3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Capn10Q9ESK3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Capn10Q9ESK3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Capn10Q9ESK3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Capn10Q9ESK3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Capn10Q9ESK3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Capn10Q9ESK3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Capn10Q9ESK3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Capn10Q9ESK3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Capn10Q9ESK3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Capn10Q9ESK3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Capn10Q9ESK3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Capn10Q9ESK3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Capn10Q9ESK3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Capn10Q9ESK3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Capn10Q9ESK3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Capn10Q9ESK3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Capn10Q9ESK3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Capn10Q9ESK3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Capn10Q9ESK3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Capn10Q9ESK3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Capn10Q9ESK3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Capn10Q9ESK3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Capn10Q9ESK3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Capn10Q9ESK3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Capn10Q9ESK3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Capn10Q9ESK3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Capn10Q9ESK3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Capn10Q9ESK3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Capn10Q9ESK3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Capn10Q9ESK3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Capn10Q9ESK3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Capn10Q9ESK3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Capn10Q9ESK3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Capn10Q9ESK3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Capn10Q9ESK3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Capn10Q9ESK3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Capn10Q9ESK3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Capn10Q9ESK3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Capn10Q9ESK3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Capn10Q9ESK3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Capn10Q9ESK3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Capn10Q9ESK3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Capn10Q9ESK3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Capn10Q9ESK3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Capn10Q9ESK3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms