Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW4

Clec3a, C-type lectin domain family 3 member A, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3aQ9EPW4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clec3aQ9EPW4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clec3aQ9EPW4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clec3aQ9EPW4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clec3aQ9EPW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec3aQ9EPW4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec3aQ9EPW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec3aQ9EPW4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec3aQ9EPW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clec3aQ9EPW4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clec3aQ9EPW4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec3aQ9EPW4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec3aQ9EPW4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec3aQ9EPW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec3aQ9EPW4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec3aQ9EPW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec3aQ9EPW4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec3aQ9EPW4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec3aQ9EPW4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec3aQ9EPW4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec3aQ9EPW4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec3aQ9EPW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec3aQ9EPW4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec3aQ9EPW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec3aQ9EPW4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec3aQ9EPW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec3aQ9EPW4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec3aQ9EPW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec3aQ9EPW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clec3aQ9EPW4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clec3aQ9EPW4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec3aQ9EPW4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec3aQ9EPW4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec3aQ9EPW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec3aQ9EPW4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec3aQ9EPW4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec3aQ9EPW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec3aQ9EPW4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec3aQ9EPW4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec3aQ9EPW4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec3aQ9EPW4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec3aQ9EPW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec3aQ9EPW4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec3aQ9EPW4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec3aQ9EPW4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec3aQ9EPW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec3aQ9EPW4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec3aQ9EPW4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec3aQ9EPW4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec3aQ9EPW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec3aQ9EPW4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec3aQ9EPW4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec3aQ9EPW4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec3aQ9EPW4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec3aQ9EPW4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec3aQ9EPW4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec3aQ9EPW4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec3aQ9EPW4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec3aQ9EPW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec3aQ9EPW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec3aQ9EPW4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec3aQ9EPW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec3aQ9EPW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec3aQ9EPW4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec3aQ9EPW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec3aQ9EPW4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec3aQ9EPW4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec3aQ9EPW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms