Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Clstn1Q9EPL2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Clstn1Q9EPL2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Clstn1Q9EPL2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Clstn1Q9EPL2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Clstn1Q9EPL2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Clstn1Q9EPL2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Clstn1Q9EPL2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Clstn1Q9EPL2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Clstn1Q9EPL2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clstn1Q9EPL2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clstn1Q9EPL2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clstn1Q9EPL2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clstn1Q9EPL2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clstn1Q9EPL2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clstn1Q9EPL2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clstn1Q9EPL2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clstn1Q9EPL2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Clstn1Q9EPL2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Clstn1Q9EPL2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clstn1Q9EPL2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clstn1Q9EPL2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clstn1Q9EPL2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Clstn1Q9EPL2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clstn1Q9EPL2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Clstn1Q9EPL2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Clstn1Q9EPL2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Clstn1Q9EPL2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Clstn1Q9EPL2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Clstn1Q9EPL2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clstn1Q9EPL2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Clstn1Q9EPL2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Clstn1Q9EPL2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clstn1Q9EPL2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clstn1Q9EPL2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clstn1Q9EPL2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clstn1Q9EPL2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clstn1Q9EPL2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clstn1Q9EPL2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clstn1Q9EPL2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Clstn1Q9EPL2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Clstn1Q9EPL2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clstn1Q9EPL2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Clstn1Q9EPL2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clstn1Q9EPL2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clstn1Q9EPL2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clstn1Q9EPL2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn1Q9EPL2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clstn1Q9EPL2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clstn1Q9EPL2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Clstn1Q9EPL2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Clstn1Q9EPL2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Clstn1Q9EPL2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn1Q9EPL2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn1Q9EPL2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn1Q9EPL2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn1Q9EPL2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn1Q9EPL2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clstn1Q9EPL2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clstn1Q9EPL2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clstn1Q9EPL2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Clstn1Q9EPL2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clstn1Q9EPL2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clstn1Q9EPL2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clstn1Q9EPL2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clstn1Q9EPL2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clstn1Q9EPL2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clstn1Q9EPL2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clstn1Q9EPL2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Clstn1Q9EPL2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Clstn1Q9EPL2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Clstn1Q9EPL2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clstn1Q9EPL2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clstn1Q9EPL2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clstn1Q9EPL2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clstn1Q9EPL2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clstn1Q9EPL2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clstn1Q9EPL2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clstn1Q9EPL2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clstn1Q9EPL2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clstn1Q9EPL2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Clstn1Q9EPL2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clstn1Q9EPL2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clstn1Q9EPL2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Clstn1Q9EPL2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clstn1Q9EPL2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clstn1Q9EPL2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clstn1Q9EPL2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clstn1Q9EPL2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Clstn1Q9EPL2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Clstn1Q9EPL2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Clstn1Q9EPL2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Clstn1Q9EPL2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clstn1Q9EPL2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Clstn1Q9EPL2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clstn1Q9EPL2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clstn1Q9EPL2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clstn1Q9EPL2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms