Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp2Q9EPK2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp2Q9EPK2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp2Q9EPK2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rp2Q9EPK2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rp2Q9EPK2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rp2Q9EPK2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rp2Q9EPK2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rp2Q9EPK2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp2Q9EPK2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rp2Q9EPK2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rp2Q9EPK2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rp2Q9EPK2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp2Q9EPK2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp2Q9EPK2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp2Q9EPK2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp2Q9EPK2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp2Q9EPK2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp2Q9EPK2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rp2Q9EPK2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rp2Q9EPK2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rp2Q9EPK2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rp2Q9EPK2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp2Q9EPK2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp2Q9EPK2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp2Q9EPK2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp2Q9EPK2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp2Q9EPK2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp2Q9EPK2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp2Q9EPK2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp2Q9EPK2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp2Q9EPK2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp2Q9EPK2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rp2Q9EPK2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rp2Q9EPK2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms