Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfgap1Q9EPJ9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arfgap1Q9EPJ9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Arfgap1Q9EPJ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arfgap1Q9EPJ9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arfgap1Q9EPJ9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgap1Q9EPJ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgap1Q9EPJ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgap1Q9EPJ9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgap1Q9EPJ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfgap1Q9EPJ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arfgap1Q9EPJ9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arfgap1Q9EPJ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgap1Q9EPJ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgap1Q9EPJ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgap1Q9EPJ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Arfgap1Q9EPJ9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arfgap1Q9EPJ9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgap1Q9EPJ9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgap1Q9EPJ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgap1Q9EPJ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Arfgap1Q9EPJ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arfgap1Q9EPJ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arfgap1Q9EPJ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgap1Q9EPJ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgap1Q9EPJ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfgap1Q9EPJ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfgap1Q9EPJ9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfgap1Q9EPJ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfgap1Q9EPJ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfgap1Q9EPJ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgap1Q9EPJ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgap1Q9EPJ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arfgap1Q9EPJ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arfgap1Q9EPJ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arfgap1Q9EPJ9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgap1Q9EPJ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgap1Q9EPJ9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgap1Q9EPJ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgap1Q9EPJ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgap1Q9EPJ9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgap1Q9EPJ9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfgap1Q9EPJ9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgap1Q9EPJ9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgap1Q9EPJ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgap1Q9EPJ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgap1Q9EPJ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgap1Q9EPJ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms